Se il file ha estensione
iso e non e' un sistema operativo (che contiene quindi le informazioni di boot) ma è un gioco, un software, o un contenitore di dati qualunque, puoi aggiungere ed eliminare file con 7-zip mantenendo la struttura e il formato del file originale.
Se è in altro formato
http://it.wikipedia.org/wiki/Immagine_disco allora hai bisogno necessariamente di un software come poweriso o ultraiso.
In fase di estrazione dati di norma si usa il file iso, mentre per i dati multi-traccia o CD audio si usa il bin/cue o simili.
Potresti provare a creare creare con 7-zip un contenitore vuoto con estensione iso e dentro mettergli il contenuto dell'immagine bin/cue montata con daemon tool e vedere se la nuova iso montata funziona.
Ciao.
EDIT: in alternativa il programma segnalato da luca

