Ok, ammettiamo che tu debba farlo partire da windows xp:
l'errore mi fa supporre che il gioco, visto che ha qualche annetto, sia ligio a certe regole, come per esempio l'installazione da cd rom.
Procurati un programma come magic iso o winiso o comunque un tool che ti consenta di creare un'immagine cdrom.
Estrai tutto il contenuto dei tre archivi in una cartella.
Apri il tool e crea una nuova immagine.
Incolla tutto il contenuto della cartella estratta in precedenza (mi raccomando, non la cartella, ma il contenuto, in modo che l'autorun sia sulla home dir).
Salva la iso (io ho dato il nome Fifa99.iso).
A questo punto puoi: montare l'immagine appena creata con daemon tools e far partire l'installazione oppure masterizzare l'immagine ed utilizzare il supporto creato per l'installazione.
Su windows xp funziona tutto benissimo. Nel caso avessi un altro sistema, ovviamente, ti consiglio di non masterizzare, ma provare con un software come appunto daemon tools o Alcohol 120%.
Fammi sapere.
Luca