Il gioco l'ho disinstallato, vado a memoria. Anch'io ho win 7 64 bit ed in genere è su questo sistema operativo che cerco di far girare i giochi datati, molte volte finendoli. E' il caso di Star Trek - Starfleet Academy.
Queste sono regole generali: mai installare i titoli in Programmi o Programmix86, ma direttamente in C:, meglio ancore in un'altra partizione D:, E: etc (salvo rari casi), ovviamente se il disco rigido è stato partizionato; la lettera del lettore di daemontools deve essere la prima subito dopo quella dell'/degli hard disk, quindi prima di un mast reale; dalle opzioni di daemontools bisogna attivare l'emulazione di alcune protezioni (tasto destro sull'icona nella systray-->Preferenze-->Avanzate-->Spuntare lo spuntabile); attivare le proprietà di compatibilità all'eseguibile del gioco installato, contenuto nella directory di installazione appunto.
Assicurati che la lettera del lettore virtuale sia precedente a quella del lettore/mast reale. Facendo una copia dei tuoi salvataggi, disinstalla e reinstalla in C:. Nello specifico in quella di ST Starfleet Academy ci sono due eseguibili, uno che fa partire la versione software, una che fa partire la versione accelerata d3d. Ad entrambi (uno alla volta) premi il tasto destro-->Proprietà-->Compatibilità-->Esegui w98/me e spunta tutto il resto tranne 256 colori e 640x480.
Lancia il gioco lasciando montato il 1° CD ed esegui un salvataggio subito dopo il filmato successivo alla quarta missione (il protagonista che parla con Sulu e Checkov). Esci dal gioco. Monta il 2° CD, lancia di nuovo STSA e carica l'ultimo salvataggio, dovrebbe riconoscerti il 2° CD, facendoti iniziare la 5° missione, dopo aver visto il filmato di briefing. Prova con un eseguibile, poi con l'altro se hai ancora problemi.
Ti ho appena descritto come è configurato il mio sistema. Ovviamente devi disinstallare qualsiasi altro programmo di gestione periferiche virtuali (ci potrebbero essere delle incompatibilità), e se hai un firewall software, di aggiungere il gioco (exe) ai files sicuri (dipende dal tipo di firewall). Ora veramente non ho più nulla da dirti, se altri utenti vogliono provare, ben venga. Passo e chiudo.